IZ WRPO 2014+ informuje, że dla wszystkich projektów w ramach Działania 6.3 Samozatrudnienie i przedsiębiorczość oraz 6.5 Doskonalenie kompetencji osób pracujących i wsparcie procesów adaptacyjnych, dla których umowę o dofinansowanie realizacji projektu zawarto od stycznia 2019 roku, w przypadku udzielania dotacji na rozpoczęcie działalności gospodarczej oraz wsparcia pomostowego nie jest możliwe kwalifikowanie podatku od towarów i usług VAT. Wydatki ponoszone przez uczestnika (niezależnie od jego statusu podatkowego) mogą być rozliczane wyłącznie w kwotach netto.
Ponadto, w odróżnieniu do dotychczasowych zasad, Uczestnik zobowiązany jest do rozliczenia 100% dotacji oraz wsparcia pomostowego na podstawie dokumentów źródłowych (takich jak faktury, rachunki, deklaracje ZUS DRA, dokumenty informujące o kwocie zaliczki na podatek dochodowy od osób fizycznych, umowy kupna-sprzedaży, listy płac, itp.), które pozwolą na potwierdzenie, że w ramach wydatków kwalifikowalnych nie zostanie rozliczony podatek VAT. Pamiętać należy, że maksymalna kwota dotacji (nie przekraczająca 6-krotności przeciętnego wynagrodzenia za pracę, o którym mowa w art. 2 ust. 1 pkt 28 ustawy o promocji zatrudnienia i instytucjach rynku pracy, obowiązującego w dniu przyznania wsparcia rozumianym jako dzień podpisania umowy o przyznanie wsparcia finansowego na rozpoczęcie działalności gospodarczej) jest kwotą brutto. Zatem wszelki VAT, który wystąpi, pomniejszy tę kwotę odpowiednio. IZ zaleca, aby dotacja nie była wypłacana w jednej transzy. Zaleca się wypłatę w dwóch transzach - druga transza pozwoli zweryfikować ostateczną kwotę podatku VAT jaki został faktycznie poniesiony (pamiętać należy, że kwoty wykazane w biznesplanie mogą się nieznacznie różnić od ostatecznie poniesionych wydatków). Prawidłowość weryfikacji przez Beneficjenta kwestii VAT będzie również przedmiotem kontroli Beneficjenta przez IZ.